Macbook conda 安装

下载地址：

https://repo.anaconda.com/miniconda/

选择mac对应的版本

这里用了Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh

安装步骤：

sh Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh

echo 'export PATH="/Users/用户名/miniconda3/bin:$PATH"' >> ~/.user_rc

source ~/.user_rc

配置国内镜像源：

清华源：

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda

conda config --set show_channel_urls yes

测试：

conda –version

使用conda安装其他生物信息学常用软件：

conda install fastqc

conda install trimmomatic

conda install bwa

conda install samtools

conda install spades

conda install hisat2

conda install stringtie